4% Dto. P.P.

Buenas tardes, tengo una duda y no se como resolverla. Tengo un proveedor intracomunitario que me mandas las facturas por importes x, y me da varias opciones para pagarle, si le pago dentro del plazo que el estima, me hace un 4 % de descuento, y si no me gira. Yo le pago dentro del plazo que el me indica y me descuento ese 4% de descuento a la hora de pagarle, pero aquí tengo el problema, yo contabilizo la factura por el importe que trae, pero a la hora de contabilizar el pago lo hago con el 4 % descontado, por lo que en la cta. del proveedor no se queda a cero. Como puedo saldar la cta.?. El proveedor no me envia factura de abono.
Gracias.